A HiSeq 2500 rendszer egy újgenerációs szekvenáló rendszer, mely az Illumina által fejlesztett „szekvenálás szintézissel“ technológiát alkalmazza. Két szekvenálási üzemmódot kínál fel - a High Output és a RapidRun módot. A rendszer lehetővé teszi a felhasználó számára, hogy egyszerre két „flow cell“ segítségével dolgozzon. Mindez hatalmas rugalmasságot nyújt, amely támogatja a rendszer használatát széles körű alkalmazásokra, és külonböző nagyságú szekvenálási tanulmányokra - projektekre.
Az új, nagy teljesítményű kémiának köszönhetően a High Output üzemmód a V4 reagensekkel egy szekvenálási futás alatt lehetővé tesz akár 1TB adatkihozatalt. A RapidRun üzemmód jellegzetessége, hogy képes akár 2x250 bázispár leolvasás végrehajtására.
A RapidRun üzemmód gyors és rövid idő alatt képes eredményeket generálni, lehetővé teszi bizonyos mennyiségű minta hatékony feldolgozását, és a már említett 2x250 bázispár leolvasási hossz használatát. Ez a mód alkalmas a mély lefedettségü alkalmazásokra, illetve a de novo vagy metagenomikai analízisre.
A High Output üzemmód olyan alkalmazásokra és analízisekre ideális, amelyek nagy lefedettséget ígényelnek. A RapdiRun móddal szemben 6-szor több minta feldolgozására képes, és alkalmas a nagy genomok szekvenálására. Az új HiSeq V4 szekvenálási kémia egy futás során akár 4 milliárd klaszter generálását teszi lehetővé. Ezen kívül 1TB adatkihozatalra alkalmas mindössze 6 nap alatt.
HiSeq 2500 |
Rapid Run |
High Output |
High Output |
|
|
TruSeq v3 kémia |
HiSeq v4 kémia |
Chip-Seq Transcription factor |
40 minta |
200 minta |
260 minta |
mRNA – Szekvenálás |
15 minta |
120 minta |
100 minta |
Nextera Rapid Capture Exome |
20 minta |
115 minta |
150 minta |
Teljes Humán Genom Szekvenálás |
1 minta |
6 minta |
10 minta |
De novo Szekvenálás |
1 minta |
|
|
HiSeq2500 |
High Output |
Rupid Run |
||||
Leolvasási hossz |
Dual flow cell |
Single flow cell |
Idő dual flow cell-esetén |
Dual flow cell |
Single flow cell |
Idő dual flow cell-esetén |
1 x 36 bp |
128 – 144 Gb |
64 – 72 Gb |
29 óra |
18 – 22 Gb |
9 – 11 Gb |
7 óra |
2 x 50 bp |
360 – 400 Gb |
180 – 200 Gb |
2.5 nap |
50 – 60 Gb |
25 – 30 Gb |
16 óra |
2 x 100 bp |
720 – 800 Gb |
360 – 400 Gb |
5 nap |
100 – 120 Gb |
50 – 60 Gb |
27 óra |
2 x 150 bp |
N/A |
N/A |
N/A |
150 – 180 Gb |
75 – 90 Gb |
40 óra |
Rapid Run |
High Output |
|
Flow cell / futás |
1-2 |
1-2 |
Teljesítmény |
10 - 300 Gb |
50 - 1 000 Gb |
Futás idő |
7 – 60 óra |
< 1 – 6 nap |
Maximális leolvasási hossz |
2 x 250 bp |
|
High Output |
Rapid Run |
≥ 85% bázis Q30 értéknél 2x50bp leolvasásnál |
≥ 85% bázis Q30 értéknél 2x50bp leolvasásnál |
≥ 80% bázis Q30 értéknél 2x100bp leolvasásnál |
≥ 80% bázis Q30 értéknél 2x100bp leolvasásnál |
|
≥ 75% bázis Q30 értéknél 2x150bp leolvasásnál |