HiSeq 2500 rendszer - Illumina

A HiSeq 2500 rendszer egy újgenerációs szekvenáló rendszer, mely az Illumina által fejlesztett „szekvenálás szintézissel“ technológiát alkalmazza. Két szekvenálási üzemmódot kínál fel - a High Output és a RapidRun módot. A rendszer lehetővé teszi a felhasználó számára, hogy egyszerre két „flow cell“ segítségével dolgozzon. Mindez hatalmas rugalmasságot nyújt, amely támogatja a rendszer használatát széles körű alkalmazásokra, és külonböző nagyságú szekvenálási tanulmányokra - projektekre.

Az új, nagy teljesítményű kémiának köszönhetően a High Output üzemmód a V4 reagensekkel egy szekvenálási futás alatt lehetővé tesz akár 1TB adatkihozatalt. A RapidRun üzemmód jellegzetessége, hogy képes akár 2x250 bázispár leolvasás végrehajtására.

A RapidRun üzemmód gyors és rövid idő alatt képes eredményeket generálni, lehetővé teszi bizonyos mennyiségű minta hatékony feldolgozását, és a már említett 2x250 bázispár leolvasási hossz használatát. Ez a mód alkalmas a mély lefedettségü alkalmazásokra, illetve a de novo vagy metagenomikai analízisre.

A High Output üzemmód olyan alkalmazásokra és analízisekre ideális, amelyek nagy lefedettséget ígényelnek. A RapdiRun móddal szemben 6-szor több minta feldolgozására képes, és alkalmas a nagy genomok szekvenálására. Az új HiSeq V4 szekvenálási kémia egy futás során akár 4 milliárd klaszter generálását teszi lehetővé. Ezen kívül 1TB adatkihozatalra alkalmas mindössze 6 nap alatt.

HiSeq 2500	Rapid Run	High Output	High Output
		TruSeq v3 kémia	HiSeq v4 kémia
Chip-Seq Transcription factor 15 M leolvasás 1 x 36 bp	40 minta 7 óra	200 minta 2 nap	260 minta 29 óra
mRNA – Szekvenálás 40 M leolvasás 2 x 50 bp	15 minta 16 óra	120 minta 5 nap	100 minta 2.5 nap
Nextera Rapid Capture Exome 37 Mb 100x lefedettség 2 x 100 bp	20 minta 27 óra	115 minta 10 nap	150 minta 5 nap
Teljes Humán Genom Szekvenálás 30x lefedettség	1 minta 27 óra	6 minta 11 nap	10 minta 6 nap
De novo Szekvenálás 2.5 Gb 100x lefedettség 2 x 250 bp	1 minta 60 óra

HiSeq2500	High Output			Rupid Run
Leolvasási hossz	Dual flow cell	Single flow cell	Idő dual flow cell-esetén	Dual flow cell	Single flow cell	Idő dual flow cell-esetén
1 x 36 bp	128 – 144 Gb	64 – 72 Gb	29 óra	18 – 22 Gb	9 – 11 Gb	7 óra
2 x 50 bp	360 – 400 Gb	180 – 200 Gb	2.5 nap	50 – 60 Gb	25 – 30 Gb	16 óra
2 x 100 bp	720 – 800 Gb	360 – 400 Gb	5 nap	100 – 120 Gb	50 – 60 Gb	27 óra
2 x 150 bp	N/A	N/A	N/A	150 – 180 Gb	75 – 90 Gb	40 óra

	Rapid Run	High Output
Flow cell / futás	1-2	1-2
Teljesítmény	10 - 300 Gb	50 - 1 000 Gb
Futás idő	7 – 60 óra	< 1 – 6 nap
Maximális leolvasási hossz	2 x 250 bp

High Output	Rapid Run
≥ 85% bázis Q30 értéknél 2x50bp leolvasásnál	≥ 85% bázis Q30 értéknél 2x50bp leolvasásnál
≥ 80% bázis Q30 értéknél 2x100bp leolvasásnál	≥ 80% bázis Q30 értéknél 2x100bp leolvasásnál
	≥ 75% bázis Q30 értéknél 2x150bp leolvasásnál

HiSeq 2500 rendszer - Illumina

Kapcsolódó linkek

NGS szekvenáló berendezések

Információ kérés:

HiSeq 2500 Rendszer