Dragen software - Illumina

Az újgenerációs szekvenálási technológián alapuló teljes humán exom (WES) és genom (WGS) alapú vizsgálatok[GB1]  során igen nagy mennyiségű nyers adat keletkezik. A generált adatok lehető legrövidebb időn belül történtő teljes körű bioinformatikai kiértékelése kiemelt jelentőséggel bír, ezzel nagyban csökkentve az egyes projektek megvalósítási idejét. Ezért a Magyar Genomika és Bioinformatika Központ (GenBio) Magyaroszágon elsőként integrálta lokálisan eszközparkjába és adatelemző megoldásaiba az Illumina cég által fejlesztett, a Genetica Kft által forgalmazott DRAGEN adatelemző szervert. A szerveren elérhető applikációk pontos, átfogó és hatékony másodlagos elemzési lehetőségeket kínálnak az újgenerációs szekvenálási adatokhoz. Egy WES minta bioinformatikai elemzése, nagyfokú automatizálás mellett, megközelítőleg 10 percet míg egy WGS minta 30 kiértékelése percet vesz igénybe, szemben az akár 4-12 óráig tartó hagyományos HPC alapú megoldásokkal. A szerver lehetőséget biztosít a GenBio-nak arra, hogy adatelemző szolgáltatási portfólióját még hatékonyabbá és gyorsabbá tegye, ezzel minden magyar akadémiai és ipari partnere még gyorsabb átfutási idővel kaphassa kézbe a eredményeket. A GenBio és a Genetica a következő időszakban újabb applikációkra is tervezi a szerver nyújtotta előnyöket implementálni.

2022.06.15