Long-Read Technológia - Illumina

Illumina Complete Long Read Prep Human

Az Illumina nemrégiben mutatta be az Illumina Complete Long Read Prep Human nevű új technológiát, amely lehetővé teszi a hosszú, akár 12 Kb hosszúságú DNS-fragmentumok nagy pontosságú és magas minőségű szekvenálását. Ez lehetővé teszi a genom szerkezetének részletesebb áttekintését, a genetikai mutációk és variánsok azonosítását a genom nehezen olvasható régióiban. A kit az Illumina már bizonyított technológiáját használja, időtakarékos, és csak kis mennyiségű kiindulási anyagot igényel a kiváló minőségű könyvtárak elkészítéséhez.

 

A NovaSeq 6000 és NovaSeq X rendszerek mostantól rövid és hosszú leolvasásokhoz egyaránt alkalmas eszközökké válnak, növelve rugalmasságukat és kihasználhatóságukat. A könyvtárkészítéshez nincsenek speciális mintaizolálási és extrakciós követelmények. A szükséges kiindulási DNS-mennyiség mindössze 50 ng. A teljes szekvenálási folyamatot egyszerűsíti és gyorsítja az is, hogy maga a könyvtárkészítés egy munkanap alatt elvégezhető.

 

Előnyök:

 

NovaSeq 6000 és az új NovaSeq X eszközök alkalmasak mind a rövid, mind a hosszú leolvasásokhoz

Speciális mintaizolálási és extrakciós követelmények nélkül

A kiindulási DNS-mennyiség mindössze 50 ng

Könyvtárkészítés 1 nap alatt

Akár 12 Kb hosszúságú fragmentumok

Technológia:

 

Az Illumina Complete Long Read Prep Human abban különbözik a hagyományos könyvtárkészítési eljárásoktól, hogy elhagyja a mechanikus DNS-fragmentálást, és ezt a lépést a hosszú szálak jelölésével helyettesíti. Ez lehetővé teszi a megszakítás nélküli, kiváló minőségű hosszú olvasásokat, amelyek fontosak az átfogó genomadatok megszerzéséhez. A rövid leolvasásokból származó adatokkal kombinált elemzés tovább javítja a kapott szekvenálási minőséget.

Az Illumina ezentúl hosszú a leolvasási technológiát javasolja alkalmazni a humán genom olyan problémás régióinak elemzésére, ahol a rövid leolvasások pontatlanok lehetnek. Az SNV (Single Nucleotide Variant) és az Indel (Insertion-Deletion) genotipizálási pontossága mindkét technológia esetében nagyon magas. Az SV (strukturális variánsok) esetében azonban az elemzés pontossága sokkal magasabb a hosszú leolvasási technológiával. Így a hosszú leolvasások használata hasznos a nagyobb pontosság és az eredmények megbízhatóságának eléréséhez a nagy genomikai variabilitású és komplexitású régiókban.

 

Készletek:

Kat.sz.                   Név

20086823            Illumina Complete Long Read Prep, Human                                      8 minta

20100421            Illumina Complete Long Read DRAGEN Cloud Analysis                   1 analízis

20098166            llumina Unique Dual Indexes, LT (48 Indexes)                                  48 minta