MiSeq Rendszer - Illumina

A MiSeq Rendszer:
• A szekvenálás mindössze egy gombnyomással elindítható, ezáltal  a „mintától az eredményig“ munkafolyamat a felhasználó beavatkozása nélkül zajlik. Integrált és automatizált rendszer, amely nem igényel felhasználói beavatkozást, ezáltal kizárja az esetleges hibákat.
• A MiSeq a leggyorsabb és legsokoldalúbb megoldás abban az esetben, ha a kísérletre rendelkezésre álló idő limitált. A szekvenálási folyamat (beleértve a nyers adatok feldolgozását) akár 8 óra is lehet
• Adatminőség a legmagasabb szinten - A „Sequencing By Synthesis” technológia felhasználásával hozták létre a világon elérhető összes szekvenciaadat több mint 90%-át.
• Kulcsfontosságú alkalmazásokra optimalizált rendszer. Változtatható olvasási hossz és a kihozatal segítségével a MiSeq rendszeren történő szekvenálást szakmai követelményeink és költségvetési lehetőségeink alapján alakíthatjuk

A rendszer bemutatása
A MiSeq újgenerációs szekvenáló rendszer egy költséghatékony asztali szekvenáló megoldás, mely az Illumina „szekvenálás szintézissel“ technológiáját alkalmazva elérhetővé teszi a szekvenálás használatát számos területen.  A MiSeq rendszeren a „mintátol az eredményig“ munkafolyamat mindössze 8 óra alatt megvalósítható. A MiSeq egy integrált rendszer, amely képes az amplifikálást, szekvenálást és az adatelemzést végrehajtani, kompakt méretéből eredően minimális laboratóriumi helyet igényel. A rendszer az Illumina által fejlesztett SBS technológia segítségével a TruSeq szekvenáló kémiát használja, amely a gyors illetve alacsony költségvetésű genetikai analízisek széles körű alkalmazása révén ideális platformmá teszi a rendszert.

Szekvenálás egyetlen gombnyomással
Jelenleg a MiSeq rendszer rendelkezik a legegyszerűbb szekvenálási módszerrel az újgenerációs szekvenálók közul. Felhasználóbarát érintőképernyős kezelőfelületének és az előkészített reagenseknek köszönhetően nagyon egyszerű a készülék használata és kezelése. A készülék a reagensek LOT számának azonosításával rendelkezik. A kompakt MiSeq alkalmas a klaszterek képzésére, paired-end olvasásra és az adatok elemzésére is. Ennek köszönhetően az egyéb kiegészítő berendezések szükségtelenné válnak, így a laboratóriumban minimális helyigény szükséges. A MiSeq szekvenáló rendszer interneten keresztül kapcsolódhat az Illumina felhőalapú szolgáltatásához, a „Basespace”-hez. A Basespace környezetben elérhető alkalmazások lehetővé teszik az olyan másodlagos adatértékelési lépések végrehajtását, mint a szekvencia illesztés, variáns azonosítás, annotálás, vizualizálás és adat interpretálás.

A leggyorsabb szekvenálás és mintaelőkészítés
A MiSeq rendszer a gyors minta-előkészítéssel kombinálva a legyszerűbb és leggyorsabb újgeneráció szekvenálást teszi elérhetővé. Az eredmények kiértékelése napok helyett órákban mérhető. A Nextera típusú könytárkészítő reagens segítségével a szekvenáláshoz használt könyvtárak készítése mindösszesen 90 percet vesznek igénybe. Ezt követően a Miseq készüléken automatizált klonális amplifikáció és szekvenálás alkalmazása 4 óra alatt végrehajtható. A rendszerbe integrált vezérlő számítógép használatával a MiSeq rendszer alkalmas a teljes adatelemzést mindösszesen 3 óra alatt elvégezni.

Bizonyított adatminőség
Az Illumina által kifejlesztett szekvenálás szintézissel technológia alapján többmillió fragmens tömeges párhuzamos szekvenálása a reverzibilis terminátor segítségével valósul meg.  A szekvenálás közben növekvő DNS-szál minden egyes bázis kötődése után detektálva van a fluoreszcens terminátor jele. A fluoreszcensen jelölt terminátor minden egyes dNTP hozzáadása után lehasad, így lehetövé teszi a következő bázis beépülését. Annak köszönhetően, hogy szekvenáláskor minden egyes ciklus során mind a négy revezibilis terminátorral jelölt dNTP jelen van, eliminálódik a komplementer bázis párosítás szabálya általi hibák lehetséges bekövetkezése. A beépített bázist minden egyes ciklus során közvetlenül a fluoreszcens jel erősségének meghatározásával detektálják. Minden egyes ciklus során egyetlen bázis épül be a növekvő DNS-szálba. Ebből kifolyólag az Illumina által kifejlesztett szekvenálás szintézissel technológia nagyon pontos, és jelentősen csökkenti a hibák előfordulását összehasonlítva más technológiákkal szemben. A végeredmény egy nagyon pontos bázisról bázisra szekvenálás, amely eliminálja a szekvenálással összefüggő hibákat, és ezzel lehetővé teszi olyan leolvasások végrehajtását is, mint a repetitiv szekvenciák és homopolimerek szekvenálása.

Az Illumina által használt szekvenálás a TruSeq technológián alapszik. Jellegzetessége, hogy a felhasználóknak a legmagasabb adatintegritást nyújtja a legmagasabb hibátlan leolvasás hozamával és a legtöbb bázis-leolvasások számával Q30 minőségi érték felett.

Optimalizált rendszer kulcsfontosságú alkalmazásokra
Fedezze fel a lehető legszélesebb körű szekvenálási alkalmazásokat. Változtatható leolvasási hossz és adatkihozatal, single-read vagy paired-end módban történő leolvasás a felhasználó számára lehetövé teszi, hogy a kísérletet az időkorlátoknak megfelelően megtervezze. Végezzen gyors és költség hatékony szekvenálást mint például amplikon szekvenálást a TruSeq Custom Amplicon segítségével, TruSeq Custom Enrichment segítségével, kis genomok de novo illetve újraszekvenálását, kis RNS szekvenálást,  szekvenálási könyvtár minőségellenőrizését, valamint 16S metagenom szekvenálást. A MiSeq újgenerációs szekvenáló segítségével a szekvenálást a felhasználó költséget és időt megtakarítva végezheti el.

Kapcsolódó linkek

MiSeq szekvenáló kitek