NextSeq 500 Rendszer - Illumina

Nagy kapacitású NGS rendszer széles körű alkalmazásra

Az Illumina NextSeq 500 újgenerációs szekvenáló készüléke egy nagy áteresztőképességű, gyors asztali szekvenáló berendezés, mely az Illumina „Sequencing By Synthesis” technológiáját alkalmazva teszi elérhetővé a szekvenálás használatát számos területen. A „Sequencing By Synthesis” technológia felhasználásával hozták létre a világon elérhető összes szekvenciaadat több mint 90%-át.

A készülék innovatív integrált „mintától az eredményig” munkafolyamata lehetővé teszi a transzkriptomok, exomok, valamint célzott genetikai panelek egy reakcióban történő szekvenálását. A NextSeq 500 áteresztőképessége rugalmasan változtatható, így kisebb kihozatalra váltva kisebb áteresztőképességű feladatok ellátására is megfelelő.

A NextSeq 500 többek között alkalmas a következő feladatok végrehajtására:
• Egy humán genom 30X lefedettségű szekvenálása
• 1-16 exom szekvenálása
• 1-20 transzkriptom szekvenálása
• 6-96 célzott genetikai panel szekvenálása
• 12-40 génexpressziós profil szekvenálása

A NextSeq 500 szekvenáló készülék maximális futási ideje 29 óra, mely lehetővé teszi a munkamenetek korábban nem látott mértékű felgyorsítását.

A NextSeq 500 szekvenáló készülék integráltan támogatja a „paired-end” típusú szekvenálást, melynek keretében akár 2*150 bp leolvasásokra is képes. A készülék kompatibilis az Illumina teljes könyvtárkészítő és „target enrichment” portfóliójával.

A NextSeq 500 szekvenáló készülék számos adatértékelési megközelítést támogat. A berendezésbe integrált nagy teljesítményű számítógép végzi a „base calling” és a „quality scoring” folyamatát. A szekvenálás során generált adatok elemzésére számos szabad hozzáférésű alkalmazás áll rendelkezésre.

A NextSeq 500 szekvenáló interneten keresztül kapcsolódhat az Illumina felhőalapú szolgáltatásához, a „Basespace”-hez. A Basespace környezetben elérhető alkalmazások lehetővé teszik az olyan másodlagos adatértékelési lépések végrehajtását, mint a szekvencia illesztés, variáns azonosítás, annotálás, vizualizálás és adat interpretálás.

Kapcsolódó linkek

NextSeq szekvanáló kitek